ارزش اصلی آنزیم های صنعتی در جایگزینی کاتالیزورهای شیمیایی سنتی است - نه تنها می توانند کارایی واکنش را بهبود بخشند، بلکه می توانند استفاده از واکنش های شیمیایی سمی را کاهش دهند،مصرف انرژی و انتشار آلاینده های کمتردر این زمینه، چهار زمینه اصلی کاربرد آن وجود دارد:
هیدرولیز سنتی نشاسته نیاز به اسید قوی و دمای بالا (بیش از 120 درجه سانتیگراد) دارد که نه تنها انرژی زیادی مصرف می کند بلکه مواد مضر را نیز تولید می کند.α - آمیلاز درجه حرارت بالا می تواند نشاسته را به سرعت در حدود 100 درجه سانتیگراد به دکسترین تجزیه کنداین فرآیند نیاز به اسید قوی ندارد، مصرف انرژی را 30٪ کاهش می دهد و خلوص گلوکز را به بیش از 98٪ افزایش می دهد.آمیلاز مالت نشاسته را در مالت تجزیه می کند، در حالی که پروتئاز پروتئین را تجزیه می کند تا ترکیبات طعم را تولید کند، طعم آبجو را غنی تر و شفاف تر می کند.
در ساخت پنیر، روش سنتی استخراج شوره از مخاط معده گوساله گران است و منابع حیوانی محدود است.تولید صنعتی رنت میکروبی (از Aspergillus oryzae و مخمر استخراج شده) نه تنها هزینه ها را 50٪ کاهش می دهد، اما همچنین از خطر بیماری های ناشی از حیوانات جلوگیری می کند و کارایی انعقادی را 2 برابر افزایش می دهد و بیش از 80٪ از بازار جهانی rennet را اشغال می کند.شیر بدون لاکتوز که معمولاً توسط افراد مبتلا به عدم تحمل لاکتوز مصرف می شود حاوی لاکتاز است، که لاکتوز را در شیر به گلوکز و گالاکتوز تجزیه می کند، مشکلات مانند نفخ و اسهال را حل می کند.
اضافه کردن آمیلاز مالتوز در نان سازی می تواند نان را نرم تر کند و مدت عمر آن را افزایش دهد. اضافه کردن ترانسگلوتامیناز به محصولات گوشت مانند سوسیس می تواند پروتئین های گوشت را به هم متصل کند.بهبود طعم و انعطاف پذیری، و کاهش چربی.